对于这一组织18世纪资产阶级思想家曾予以抨击，欧洲一些国家曾加以取缔。1773年教宗克雷芒十四世宣布解散。1814年重新恢复。20世纪60年代以来，成为促进天主教现代化的重要力量。

同时对于华夏人来说，这一组织也是华夏最早接触的天主教组织之一。它向华夏派遣传教士始于明嘉靖年间。

第一个来到华夏的耶稣会士方济各·沙勿略（1506~1552）于嘉靖三十年（1551）抵广东海面上川岛，次年卒于该岛。

三十九年第一批耶稣会士抵达澳门。万历四年（1576）澳门教区成立。历史上自1552年至1800年，在华外国耶稣会士约七百八十多名，华夏耶稣会士约一百三十多名。他们也成为了中学西渐和西学东渐活动中最重要的思想文化交流的媒介。